El nombre de esta institución fue tomado de la sobrina del cacique Calarcá, el cual pertenecía a la tribu de los pijaos de la cultura de los indígenas Quimbaya, los cuales habitaron en el municipio inicialmente. ese barrio "ciudad boquia" fue fundado el 28 de junio de 1991 con solamente 597 viviendas bajo el gobierno del presidente cesar Gaviria Trujillo.
se calculaba que la población escolar promedio era de 800 menores para educación básica primaria, la cual fue una razón de tener dentro del barrio una institución educativa para evitar peligros a los que se exponía los niños al desplazarse hacia otras instituciones y la herrogacion de los gastos que esto influye. ante esta situación la junta de acción comunal decidió tomar cartas sobre el asunto para realizar un proyecto de construcción y dotación de una educación educativa que satisficiera las necesidades de la época.
este proyecto fue elaborado por la secretaria de educación de Pereira, allí comenzó el proceso de gestión y dinamismo requerido para poder dotar la institución. se solicito inicialmente un préstamo de la casa de modelo de la urbanización ciudad boquia lo cual fue autorizado.
nace el instituto docente ciudad boquia en 1992 debido a que fueron adjudicadas nuevas soluciones de vivienda, surge la necesidad de nuevos cupos escolares en la cual se necesita ampliar la planta personal en donde se permitiera albergar un numero mayor de estudiantes. en 1994 y 1996 fue construida la actual planta física mediante un acuerdo con el honorable concejo municipal y se crea el colegio ciudad boquia.